企业增值税、附加税、个人所得税税、个人所得税和企业所得税是肯定的，毕竟，这些税是最常见的，但行业还需要面对房地产税、车辆税、土地使用税、印花税、教育附加税等。税种多也是税收问题的主要原因。
虽然物流行业涉及的税目较多，但是其计税方法并不复杂，除按销售额全额计税外，个别涉及差额计税和可以选择简易计税。增值税的税收优惠方面主要体现在跨境业务上。需要注意的是，纳税人可以放弃适用增值税零税率，选择免税或按规定缴纳增值税。放弃适用增值税零税率后，36个月内不得再申请适用增值税零税率。
营业税、城建税、教育费附加、房产税(若存在自有房屋、仓库需缴纳)、车船使用税(若存在自有车船需缴纳)、企业所得税、个人所得税(代扣代缴职工薪酬的个税)。
